23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1692 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1692  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  359  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1720  hypothetical protein  97.22 
 
 
180 aa  328  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1805  hypothetical protein  88.33 
 
 
180 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.409746 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6299  hypothetical protein  87.22 
 
 
180 aa  321  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1780  hypothetical protein  87.22 
 
 
180 aa  321  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.507226  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5079  hypothetical protein  89.44 
 
 
180 aa  309  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1490  hypothetical protein  82.87 
 
 
181 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0740119  normal  0.142837 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2324  hypothetical protein  67.16 
 
 
193 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2196  hypothetical protein  67.16 
 
 
193 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2159  hypothetical protein  67.16 
 
 
193 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0817794  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1315  hypothetical protein  67.16 
 
 
137 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1075  hypothetical protein  67.16 
 
 
193 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0092  hypothetical protein  67.16 
 
 
193 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1804  hypothetical protein  67.16 
 
 
193 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.546944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2262  hypothetical protein  63.89 
 
 
201 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.992571  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1851  hypothetical protein  69.23 
 
 
218 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388772  normal  0.0532446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2334  hypothetical protein  57.14 
 
 
206 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0633948  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0976  hypothetical protein  57.69 
 
 
202 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1363  putative signal peptide protein  42.53 
 
 
193 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1354  putative signal peptide protein  37.5 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1580  putative signal peptide protein  37.84 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171314  normal  0.0540175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1638  putative signal peptide protein  41.94 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1909  putative signal peptide protein  37.93 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.42684  normal  0.0790998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>