54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1460 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1460  putative ParB-like nuclease  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1420  hypothetical protein  99.52 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1514  putative ParB-like nuclease  91.83 
 
 		 208 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  hitchhiker  0.00751547 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1538  hypothetical protein  92.31 
 
 		 208 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1058  hypothetical protein  92.31 
 
 		 208 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1716  putative ParB-like nuclease  89.42 
 
 		 208 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172084 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4678  hypothetical protein  88.46 
 
 		 208 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0352084  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1961  hypothetical protein  78.64 
 
 		 443 aa  346  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2525  hypothetical protein  78.16 
 
 		 208 aa  343  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0224585  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1271  hypothetical protein  78.64 
 
 		 208 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335245  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1030  hypothetical protein  78.64 
 
 		 208 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.738741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1809  hypothetical protein  78.64 
 
 		 208 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1788  hypothetical protein  78.64 
 
 		 208 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185204  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0136  hypothetical protein  78.64 
 
 		 208 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1759  hypothetical protein  78.64 
 
 		 208 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342395  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2660  putative ParB-like nuclease  52.91 
 
 		 212 aa  217  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683597  normal  0.548694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4518  putative ParB-like nuclease  50.76 
 
 		 208 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0701  Putative ParB-like nuclease  51.55 
 
 		 205 aa  208  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0740  Putative ParB-like nuclease  52.06 
 
 		 205 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0727  putative ParB-like nuclease  51.55 
 
 		 205 aa  205  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.881395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3351  hypothetical protein  48.51 
 
 		 207 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.789599  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3524  hypothetical protein  47.78 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2235  Putative ParB-like nuclease  47.74 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2187  putative ParB-like nuclease  48.45 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0352754  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0704  hypothetical protein  48.69 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15967  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4261  putative ParB-like nuclease  48.17 
 
 		 205 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0880  Putative ParB-like nuclease  47.4 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141868 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0706  hypothetical protein  46.32 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2214  hypothetical protein  45.16 
 
 		 198 aa  164  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189524  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2350  Putative ParB-like nuclease  39.18 
 
 		 199 aa  144  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4378  hypothetical protein  38.38 
 
 		 217 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4374  hypothetical protein  39 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.093636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1668  hypothetical protein  34.02 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0409439 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5254  putative ParB-like nuclease  34.87 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0513173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56990  hypothetical protein  36.41 
 
 		 228 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4955  hypothetical protein  36.41 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0887  hypothetical protein  29 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05691  hypothetical protein  26.73 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.222417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0974  hypothetical protein  27.5 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13631  hypothetical protein  26.47 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3368  putative lipoprotein  30.1 
 
 		 380 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2351  putative lipoprotein  30.1 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2530  putative lipoprotein  30.1 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3403  putative lipoprotein  30.1 
 
 		 380 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1126  putative lipoprotein  30.1 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0264  putative lipoprotein  30.1 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3409  putative lipoprotein  29.61 
 
 		 380 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1245  putative lipoprotein  29.61 
 
 		 380 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2067  putative ParB-like nuclease  34.11 
 
 		 305 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_93854  predicted protein  28.83 
 
 		 340 aa  49.3  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00630097  normal  0.0600499 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0686  hypothetical protein  34.13 
 
 		 378 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0203  hypothetical protein  34.13 
 
 		 378 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3772  hypothetical protein  34.13 
 
 		 378 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0653  putative ParB-like nuclease  33.33 
 
 		 378 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>