126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1062 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4292  arginine succinyltransferase  94.33 
 
 		 350 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0702  arginine N-succinyltransferase  94.37 
 
 		 355 aa  668    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1062  arginine N-succinyltransferase  98.58 
 
 		 353 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1181  arginine N-succinyltransferase  94.37 
 
 		 355 aa  668    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1062  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  100 
 
 		 353 aa  711    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0200119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2123  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  94.33 
 
 		 350 aa  670    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.648146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1158  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  94.37 
 
 		 355 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266781  normal  0.0623877 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1776  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  86.49 
 
 		 352 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2846  arginine N-succinyltransferase beta subunit  85.34 
 
 		 352 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2726  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  85.34 
 
 		 352 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2784  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  85.34 
 
 		 352 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0592  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  84.48 
 
 		 346 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2424  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  84.48 
 
 		 346 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.1511  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2867  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  84.48 
 
 		 346 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1735  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  84.48 
 
 		 346 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.680184  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1786  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  77.84 
 
 		 350 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2922  arginine succinyltransferase  75.07 
 
 		 352 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1559  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  74.86 
 
 		 352 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.758428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1435  arginine N-succinyltransferase  45.61 
 
 		 339 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4480  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  45.61 
 
 		 339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.98058  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3985  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  45.32 
 
 		 339 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3769  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  44.25 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3564  arginine N-succinyltransferase  43.73 
 
 		 343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1833  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  43.73 
 
 		 343 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34490  arginine N-succinyltransferase  44.02 
 
 		 338 aa  279  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52700  arginine/ornithine succinyltransferase AI subunit  42.31 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.6133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4619  arginine/ornithine succinyltransferase AI subunit  42.31 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4284  arginine succinyltransferase  42.77 
 
 		 339 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.584908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2910  arginine succinyltransferase  42.6 
 
 		 338 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.500754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2054  arginine succinyltransferase  39.18 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3318  arginine N-succinyltransferase  37.54 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3668  arginine N-succinyltransferase  39.67 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0458765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2807  arginine succinyltransferase  39.18 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2843  arginine succinyltransferase  36.63 
 
 		 344 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.836294  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0635  arginine N-succinyltransferase  35.8 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1055  arginine N-succinyltransferase  33.14 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1969  arginine succinyltransferase  34.9 
 
 		 344 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01716  arginine succinyltransferase  34.6 
 
 		 344 aa  208  9e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1895  arginine N-succinyltransferase  34.6 
 
 		 344 aa  208  9e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.564615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2465  arginine succinyltransferase  34.6 
 
 		 344 aa  208  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01704  hypothetical protein  34.6 
 
 		 344 aa  208  9e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1830  arginine succinyltransferase  34.6 
 
 		 344 aa  208  9e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1885  arginine succinyltransferase  34.6 
 
 		 344 aa  208  9e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0106586 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1444  arginine succinyltransferase  34.6 
 
 		 344 aa  208  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.606563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1994  arginine succinyltransferase  35.29 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2228  arginine succinyltransferase  35.16 
 
 		 350 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2042  arginine succinyltransferase  34.71 
 
 		 344 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1416  arginine succinyltransferase  34.71 
 
 		 344 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2519  arginine succinyltransferase  35.16 
 
 		 350 aa  206  6e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1431  arginine succinyltransferase  34.71 
 
 		 344 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.899315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1560  arginine N-succinyltransferase  36.54 
 
 		 346 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1399  arginine succinyltransferase  34.71 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.121302 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1869  arginine succinyltransferase  34.71 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1627  arginine N-succinyltransferase  32.76 
 
 		 348 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.299273 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1063  arginine N-succinyltransferase  38.04 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2120  arginine succinyltransferase  35.17 
 
 		 349 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1063  arginine N-succinyltransferase  36.39 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3669  arginine N-succinyltransferase  35.9 
 
 		 350 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.386578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1697  arginine succinyltransferase  34.6 
 
 		 344 aa  202  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2194  putative arginine/ornithine succinyltransferase  34.72 
 
 		 339 aa  202  8e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0883  arginine succinyltransferase  33.33 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174815  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3192  arginine N-succinyltransferase  32.65 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0337373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0656  arginine N-succinyltransferase  32.06 
 
 		 339 aa  199  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.868394  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0703  arginine N-succinyltransferase  36.96 
 
 		 343 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1182  arginine N-succinyltransferase  36.96 
 
 		 343 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.187182  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2122  arginine N-succinyltransferase  36.08 
 
 		 348 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1159  arginine N-succinyltransferase  36.96 
 
 		 343 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26404  normal  0.0654026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2921  arginine succinyltransferase  35.96 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.651402  normal  0.342556 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1940  arginine N-succinyltransferase  32.74 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3298  arginine N-succinyltransferase  32.94 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00498  arginine N-succinyltransferase  35.16 
 
 		 345 aa  196  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1665  arginine N-succinyltransferase, beta chain  28.49 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2845  arginine N-succinyltransferase beta subunit  37.32 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3317  arginine N-succinyltransferase  34.07 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2725  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  37.32 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2783  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  37.32 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472941  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002276  arginine N-succinyltransferase  34.12 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1671  arginine N-succinyltransferase, beta chain  29.07 
 
 		 346 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1777  arginine N-succinyltransferase beta subunit  37.68 
 
 		 343 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3010  arginine N-succinyltransferase  33.24 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4293  arginine succinyltransferase  36.55 
 
 		 343 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0650  arginine N-succinyltransferase  31.96 
 
 		 344 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0810  arginine N-succinyltransferase  31.76 
 
 		 339 aa  193  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028495 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3515  arginine N-succinyltransferase  33.24 
 
 		 339 aa  192  9e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0593  arginine N-succinyltransferase, beta chain  37.04 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52690  arginine/ornithine succinyltransferase AII subunit  35.19 
 
 		 340 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.433336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2423  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  37.04 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.441325  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2868  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  37.04 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1734  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  37.04 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.559674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00078  arginine N-succinyltransferase  33.82 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4618  arginine/ornithine succinyltransferase AII subunit  35.19 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311562  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1857  arginine succinyltransferase  34.52 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0210097  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1834  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  34.31 
 
 		 341 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.860406  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0612  arginine succinyltransferase  31.76 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0611  arginine succinyltransferase  31.76 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0978523 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0572  arginine N-succinyltransferase  31.76 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0579  arginine N-succinyltransferase  31.47 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.934676 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1785  arginine N-succinyltransferase  35.51 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3563  arginine N-succinyltransferase  34.02 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3418  arginine succinyltransferase  31.76 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0994163 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>