19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0881 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0881  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  258  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.691837  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0869  hypothetical protein  96.9 
 
 
155 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0531  hypothetical protein  86.05 
 
 
155 aa  228  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1009  hypothetical protein  86.05 
 
 
155 aa  228  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000222538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0969  hypothetical protein  85.27 
 
 
129 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0219351  normal  0.234882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4117  hypothetical protein  83.72 
 
 
155 aa  223  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000467794  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2389  hypothetical protein  82.17 
 
 
129 aa  214  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0478  hypothetical protein  64.66 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.492796  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2937  hypothetical protein  65.41 
 
 
129 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000524885  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1002  hypothetical protein  64.66 
 
 
129 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0144  hypothetical protein  64.66 
 
 
129 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.336131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2632  hypothetical protein  64.66 
 
 
129 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3038  hypothetical protein  64.66 
 
 
158 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000389489  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3001  hypothetical protein  64.66 
 
 
129 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0405759  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1597  hypothetical protein  64.66 
 
 
158 aa  147  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000856249  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4135  putative transmembrane protein  48 
 
 
133 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4247  hypothetical protein  48 
 
 
133 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05317  hypothetical protein  50 
 
 
155 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.675119  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0680  hypothetical protein  50.45 
 
 
112 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.766196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>