11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0397 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0397  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  246  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0376  hypothetical protein  97.52 
 
 
121 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2644  hypothetical protein  80 
 
 
105 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0462  hypothetical protein  80 
 
 
105 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0440  hypothetical protein  79.05 
 
 
105 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3554  hypothetical protein  74.53 
 
 
105 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312649  normal  0.914375 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0394  hypothetical protein  79.79 
 
 
111 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2935  hypothetical protein  67.96 
 
 
135 aa  147  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0373  hypothetical protein  76.6 
 
 
97 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4991  hypothetical protein  39.77 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1072  hypothetical protein  34.95 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>