72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3414 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2639  putative lipoprotein  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2452  putative lipoprotein  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3449  putative lipoprotein  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0369  putative lipoprotein  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3414  putative lipoprotein  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1228  putative lipoprotein  100 
 
 
183 aa  370  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3450  putative lipoprotein  100 
 
 
176 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.978876  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1212  putative lipoprotein  92.59 
 
 
176 aa  290  7e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  73.84 
 
 
183 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  74.42 
 
 
183 aa  262  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  73.84 
 
 
183 aa  260  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  67.05 
 
 
183 aa  251  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  72.12 
 
 
176 aa  249  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  72.12 
 
 
176 aa  249  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  73.94 
 
 
176 aa  250  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  70.48 
 
 
177 aa  241  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3379  rare lipoprotein B  64.53 
 
 
183 aa  236  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000235513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0577  rare lipoprotein B  66.05 
 
 
169 aa  229  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330293  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  46.58 
 
 
171 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  41.98 
 
 
168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2743  putative lipoprotein B precursor transmembrane  43.75 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2572  Rare lipoprotein B  43.06 
 
 
174 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136179  normal  0.613264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2982  Rare lipoprotein B  43.06 
 
 
174 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  39.04 
 
 
175 aa  95.1  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  38.57 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0759  rare lipoprotein B  36.99 
 
 
163 aa  86.3  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  33.75 
 
 
179 aa  85.1  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3785  rare lipoprotein B  34.88 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202696  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  30.32 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6002  rare lipoprotein B  32.89 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3265  Rare lipoprotein B  33.56 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3916  rare lipoprotein B  33.56 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4547  rare lipoprotein B  35.58 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4604  rare lipoprotein B  32.65 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  33.1 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0217  putative lipoprotein B precursor  34.97 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0255  rare lipoprotein B precursor  30.3 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  28.19 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1072  rare lipoprotein B  35.17 
 
 
167 aa  67  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0423  Rare lipoprotein B  34.69 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0233  rare lipoprotein B precursor  27.22 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  34.38 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  32.08 
 
 
201 aa  62  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0480  rare lipoprotein B  28.06 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0401  rare lipoprotein B-like protein  30.13 
 
 
179 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  29.01 
 
 
164 aa  52  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  29.7 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  31.18 
 
 
184 aa  48.9  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  31.76 
 
 
184 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2144  rare lipoprotein B  28.57 
 
 
173 aa  48.5  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2864  rare lipoprotein B  26.83 
 
 
164 aa  47.8  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  28.75 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01875  lipoprotein  30.34 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2930  rare lipoprotein B  30.51 
 
 
164 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.692064  decreased coverage  0.00636409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  26.75 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  27.75 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  24.22 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  25.3 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  25.5 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  28.82 
 
 
203 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  26.54 
 
 
164 aa  44.7  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1000  rare lipoprotein B  26.54 
 
 
164 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115178  normal  0.163142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1061  rare lipoprotein B  26.54 
 
 
164 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.702288  hitchhiker  0.00672321 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0996  rare lipoprotein B  26.54 
 
 
164 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.106946  normal  0.100935 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1310  rare lipoprotein B  27.78 
 
 
202 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4670  rare lipoprotein B  25.47 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1173  rare lipoprotein B  26.54 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3144  rare lipoprotein B  25.93 
 
 
164 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000366189  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4795  rare lipoprotein B  24.85 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.167693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0626  rare lipoprotein B  26.09 
 
 
201 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4848  rare lipoprotein B  25.44 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1377  rare lipoprotein B precursor  27.78 
 
 
220 aa  41.6  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0925703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>