21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0123 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1596  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  988    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0977931  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0113  PqaA  88.41 
 
 		 495 aa  883    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0147  PqaA protein  99.38 
 
 		 483 aa  980    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0123  PqaA protein  100 
 
 		 483 aa  986    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434037  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05517  putative transmembrane protein  57.44 
 
 		 517 aa  548  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01585  PhoPQ-regulated protein  52.88 
 
 		 501 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0207412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1626  PqaA protein  50.75 
 
 		 496 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1648  PqaA protein  50.54 
 
 		 496 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439725  normal  0.998647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1792  PqaA protein  50.11 
 
 		 496 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1656  PqaA protein  50.11 
 
 		 496 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1715  PqaA protein  50.11 
 
 		 496 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4917  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  43.18 
 
 		 473 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5043  hypothetical protein  42.95 
 
 		 486 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3217  hypothetical protein  26.67 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1834  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  28.57 
 
 		 423 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1797  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  28.46 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0548814  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6614  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein PqaA type  26.21 
 
 		 457 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1356  hypothetical protein  26.99 
 
 		 439 aa  111  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1682  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  28.06 
 
 		 425 aa  90.5  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.636927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2842  hypothetical protein  22.87 
 
 		 494 aa  50.4  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2286  hypothetical protein  22.86 
 
 		 494 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>