12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2001 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II2001  gp30  100 
 
 
244 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274125  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1357  gp30  50 
 
 
245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200548  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0118  gp30  51.15 
 
 
249 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427468  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0212  VRR-NUC domain-containing protein  49.22 
 
 
256 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143344  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0643  VRR-NUC domain-containing protein  48.54 
 
 
255 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04485  hypothetical protein  36.22 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53650  hypothetical protein  43.1 
 
 
148 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00626606  hitchhiker  0.000571766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0702  hypothetical protein  30.65 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2141  hypothetical protein  30 
 
 
427 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3537  VRR-NUC domain protein  30.49 
 
 
449 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3534  VRR-NUC domain protein  26.25 
 
 
449 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0890  hypothetical protein  36 
 
 
334 aa  46.6  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.451004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>