19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0113 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1596  hypothetical protein  88.28 
 
 		 495 aa  901    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0977931  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0113  PqaA  100 
 
 		 495 aa  1015    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0147  PqaA protein  88.2 
 
 		 483 aa  881    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0123  PqaA protein  88.41 
 
 		 483 aa  883    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434037  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05517  putative transmembrane protein  56.1 
 
 		 517 aa  557  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01585  PhoPQ-regulated protein  51.27 
 
 		 501 aa  499  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0207412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1626  PqaA protein  49.24 
 
 		 496 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1648  PqaA protein  49.24 
 
 		 496 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439725  normal  0.998647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1715  PqaA protein  48.81 
 
 		 496 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1792  PqaA protein  48.81 
 
 		 496 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1656  PqaA protein  48.81 
 
 		 496 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.568365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4917  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  40.98 
 
 		 473 aa  359  7e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5043  hypothetical protein  40.76 
 
 		 486 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3217  hypothetical protein  27.95 
 
 		 454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1797  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  28.91 
 
 		 423 aa  123  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0548814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1834  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  28.37 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6614  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein PqaA type  27.53 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1356  hypothetical protein  28.06 
 
 		 439 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440655  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1682  PhoPQ-activated pathogenicity-related protein-like protein  28.04 
 
 		 425 aa  90.1  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.636927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>