15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1516 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1516  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  344  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1466  hypothetical protein  98.24 
 
 
170 aa  260  6e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1649  hypothetical protein  62.13 
 
 
150 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.989787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2137  hypothetical protein  40.23 
 
 
129 aa  95.5  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150789  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2744  hypothetical protein  42.65 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3004  BA14K family protein  42.4 
 
 
150 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2239  hypothetical protein  53.64 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0987  hypothetical protein  35.8 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.283754  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2136  hypothetical protein  45.12 
 
 
210 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129106  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2373  hypothetical protein  40 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00903594  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5051  hypothetical protein  65.38 
 
 
134 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  61.54 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1022  BA14K-like  57.69 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4232  hypothetical protein  47.62 
 
 
235 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2438  hypothetical protein  65.38 
 
 
124 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>