24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7643 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7643  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  510  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5347  hypothetical protein  38.91 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.7075  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0242  hypothetical protein  36.65 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5040  hypothetical protein  37.72 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.12957  hitchhiker  0.00322129 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0247  hypothetical protein  33.98 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0297  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.246483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2427  hypothetical protein  27.23 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4569  hypothetical protein  26.06 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1483  hypothetical protein  26.42 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2861  hypothetical protein  27.64 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.613567  normal  0.192183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0967  hypothetical protein  28.95 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2069  hypothetical protein  28.57 
 
 		 277 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3066  hypothetical protein  36.26 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1536  hypothetical protein  36.26 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38947  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0123  hypothetical protein  36.26 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3001  hypothetical protein  36.26 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2011  hypothetical protein  27.57 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1493  hypothetical protein  26.47 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0115  hypothetical protein  23.93 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3992  hypothetical protein  36.59 
 
 		 264 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3920  hypothetical protein  36.59 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3304  hypothetical protein  36.59 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1830  hypothetical protein  27.11 
 
 		 284 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2527  hypothetical protein  27.48 
 
 		 293 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35785  normal  0.669591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>