24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6403 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6403  4-vinyl protochlorophyllide reductase  100 
 
 		 234 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0613  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  53.89 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0788482  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3813  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  42.11 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1863  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  44.79 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1486  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  44.21 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3864  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  43.68 
 
 		 236 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.9168  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2636  putative bacteriochlorophyll synthase 23 kDa chain  46.07 
 
 		 207 aa  148  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213948  normal  0.17741 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1015  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  45.21 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1626  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  42.11 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1923  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  44.68 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0280  bacteriochlorophyll synthase, 23 kDa subunit (bchJ)  44.68 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.167745  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3584  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  46.03 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0940  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  37.69 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2248  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  38.5 
 
 		 190 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2379  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  38.29 
 
 		 194 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2022  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  37.97 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0585684 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0218  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  36.36 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2191  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  33.51 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0317  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  35.11 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0328  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  34.21 
 
 		 190 aa  99  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111489  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1810  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  35.75 
 
 		 190 aa  98.6  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1582  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  36.32 
 
 		 201 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2280  bacteriochlorophyll 4-vinyl reductase  42.86 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0960  4-vinyl reductase 4VR  30 
 
 		 197 aa  48.5  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>