27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2092 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2092  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  293  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2467  hypothetical protein  44.27 
 
 
146 aa  120  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4776  hypothetical protein  39.86 
 
 
145 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46310  hypothetical protein  41.04 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0076  hypothetical protein  42.45 
 
 
168 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1372  hypothetical protein  38.82 
 
 
161 aa  103  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2135  hypothetical protein  39.57 
 
 
151 aa  99.4  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3607  hypothetical protein  35.25 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.9799  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0342  hypothetical protein  36.43 
 
 
146 aa  94.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3765  hypothetical protein  37.14 
 
 
146 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2062  hypothetical protein  32.28 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0457353  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2149  hypothetical protein  31.21 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0925  hypothetical protein  36.75 
 
 
118 aa  81.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13970  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.607556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3329  hypothetical protein  34.75 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1403  hypothetical protein  32.85 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628547  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  40.78 
 
 
418 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0392  hypothetical protein  32.85 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.2643  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3527  hypothetical protein  36.69 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2280  hypothetical protein  30.22 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1294  hypothetical protein  31.3 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2121  hypothetical protein  31.54 
 
 
196 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277797  normal  0.0126504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1455  hypothetical protein  29.13 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0296741  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0648  Protein of unknown function DUF2267  27.73 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270306  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0380  hypothetical protein  25 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4770  hypothetical protein  28.44 
 
 
125 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.444502  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0149  hypothetical protein  22.73 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>