13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1408 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1408  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  457  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  0.630193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0484  hypothetical protein  68.16 
 
 
202 aa  221  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.173769 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3468  hypothetical protein  31.22 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.671623  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2884  hypothetical protein  28.12 
 
 
202 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.218946  normal  0.339183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0327  hypothetical protein  27.46 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2068  hypothetical protein  27.46 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38348  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4923  hypothetical protein  30.14 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3582  hypothetical protein  29.76 
 
 
199 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0328  hypothetical protein  24.6 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.643277  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2067  hypothetical protein  24.6 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0220632  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3317  hypothetical protein  28.35 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2903  hypothetical protein  27.07 
 
 
202 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.500349  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2059  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>