14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0641 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0641  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3746  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  29.1 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.521801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4223  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  26.42 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36844  predicted protein  27.94 
 
 		 382 aa  55.8  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0742  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  28.07 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2056  hypothetical protein  25.25 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0248  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  28.26 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.323725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2763  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  25.15 
 
 		 222 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.076486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1318  hypothetical protein  27.71 
 
 		 227 aa  45.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.000000517485 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2907  hypothetical protein  28.68 
 
 		 434 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2046  hypothetical protein  26.63 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15378  hitchhiker  0.00220889 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  32.14 
 
 		 434 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1531  hypothetical protein  29.32 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.842491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4841  hypothetical protein  25.23 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>