62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0117 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0117  GNAT family acetyltransferase  100 
 
 
168 aa  338  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.660211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5794  GCN5-related N-acetyltransferase  53.52 
 
 
158 aa  153  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1502  putative acyltransferase  35.92 
 
 
151 aa  90.9  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0860321  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1534  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
172 aa  89  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000293271 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1555  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
172 aa  85.9  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000437299 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 
184 aa  70.9  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04462  acetyltransferase, gnat family  35.88 
 
 
198 aa  61.2  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0599  hypothetical protein  32.82 
 
 
192 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0681  hypothetical protein  32.82 
 
 
192 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1097  GCN5-related N-acetyltransferase  34.33 
 
 
198 aa  51.2  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  37.63 
 
 
181 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2440  GCN5-related N-acetyltransferase  35.87 
 
 
158 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961994  hitchhiker  0.00680494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0784  GNAT family acetyltransferase  34.78 
 
 
158 aa  47.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2758  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 
161 aa  47.4  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3162  acetyltransferase, GNAT family  27.41 
 
 
161 aa  47.4  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0396  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
183 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617467  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1369  Phosphinothricin acetyltransferase  35.78 
 
 
177 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5489  GCN5-related N-acetyltransferase  41.25 
 
 
176 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385408  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  31.65 
 
 
163 aa  45.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  37.1 
 
 
186 aa  45.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  37.18 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3298  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 
185 aa  44.3  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000192346  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
185 aa  44.3  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4361  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
174 aa  44.3  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.227098  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2150  acetyltransferase  26.49 
 
 
206 aa  43.9  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000318542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1883  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
197 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.278862  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2108  GCN5-related N-acetyltransferase  41.94 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.98 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5346  GCN5-related N-acetyltransferase  38.04 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1515  acetyltransferase  32.43 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.42472  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1933  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171947  hitchhiker  0.00199568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7237  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.354809  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0771  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2871  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
154 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0236  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
154 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0385  phosphinothricin acetyltransferase (PPT N-acetyltransferase)  33.65 
 
 
176 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1383  acyltransferase-like protein  35.06 
 
 
170 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569267  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3735  GCN5-related N-acetyltransferase  32.22 
 
 
185 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2779  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
165 aa  41.6  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6053  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
180 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134247  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4058  GCN5-related N-acetyltransferase  31.19 
 
 
200 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1088  acetyltransferase  41.27 
 
 
187 aa  41.2  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4434  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189949  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1952  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
139 aa  41.2  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106048  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3580  GCN5-related N-acetyltransferase  33.8 
 
 
183 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1811  acetyltransferase  41.27 
 
 
169 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0442  acetyltransferase  41.27 
 
 
169 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0205  acetyltransferase  41.27 
 
 
187 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1897  putative acetyltransferase protein  41.27 
 
 
187 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.385143  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1401  acetyltransferase  41.27 
 
 
187 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277124  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0356  acetyltransferase  41.27 
 
 
169 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0940  acetyltransferase  41.27 
 
 
169 aa  40.8  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3356  GCN5-related N-acetyltransferase  34.41 
 
 
173 aa  40.8  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1244  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
177 aa  40.8  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0357643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3512  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
183 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6752  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
146 aa  40.8  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0421708  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1342  phosphinothricin N-acetyltransferase, putative  29.21 
 
 
171 aa  40.8  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.952982  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3430  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
183 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.137852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>