65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29320 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_29320  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  337  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1747  hypothetical protein  58.28 
 
 
163 aa  190  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2358  protein of unknown function DUF336  56.25 
 
 
172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.61424  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1660  hypothetical protein  53.7 
 
 
165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0922603  normal  0.0534906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2653  hypothetical protein  53.99 
 
 
165 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.86632  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2914  hypothetical protein  54.32 
 
 
165 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963659  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2506  hypothetical protein  53.09 
 
 
165 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1674  hypothetical protein  51.85 
 
 
165 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.172273 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1996  hypothetical protein  54.9 
 
 
161 aa  177  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954543 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1246  hypothetical protein  52.47 
 
 
165 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1983  hypothetical protein  52.47 
 
 
189 aa  175  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1731  hypothetical protein  52.47 
 
 
189 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0773  hypothetical protein  52.47 
 
 
165 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1831  hypothetical protein  52.47 
 
 
189 aa  175  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0389  hypothetical protein  52.47 
 
 
165 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1814  hypothetical protein  52.47 
 
 
189 aa  174  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1480  hypothetical protein  50.62 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166685  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2872  hypothetical protein  51.83 
 
 
164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1459  hypothetical protein  50 
 
 
165 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1558  hypothetical protein  49.38 
 
 
165 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526208  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1078  hypothetical protein  49.38 
 
 
165 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1534  hypothetical protein  49.38 
 
 
165 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0452  hypothetical protein  53.09 
 
 
172 aa  168  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4700  hypothetical protein  48.77 
 
 
165 aa  167  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.786571  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2503  hypothetical protein  47.53 
 
 
165 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1734  hypothetical protein  46.91 
 
 
165 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216168  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1914  protein of unknown function DUF336  44.44 
 
 
178 aa  142  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.180095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1764  hypothetical protein  50.34 
 
 
160 aa  142  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1581  hypothetical protein  47.71 
 
 
171 aa  134  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1792  hypothetical protein  48.67 
 
 
171 aa  134  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.575731 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5390  hypothetical protein  48.63 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2342  hypothetical protein  45.77 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003593  hypothetical protein  44.9 
 
 
158 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1243  hypothetical protein  37.01 
 
 
159 aa  122  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0924995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3413  hypothetical protein  40.91 
 
 
206 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3196  hypothetical protein  40.91 
 
 
216 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3175  hypothetical protein  40.91 
 
 
158 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000510798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3449  hypothetical protein  40.91 
 
 
158 aa  119  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3104  hypothetical protein  40.91 
 
 
216 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3413  hypothetical protein  40.91 
 
 
158 aa  117  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3401  hypothetical protein  40.26 
 
 
158 aa  117  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1842  hypothetical protein  40.26 
 
 
158 aa  117  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.935839 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3426  hypothetical protein  40.26 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4513  hypothetical protein  36.65 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3106  hypothetical protein  38.31 
 
 
158 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.025404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1766  hypothetical protein  40.38 
 
 
169 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.267084  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4062  hypothetical protein  43.79 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.628231  normal  0.565272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2291  protein of unknown function DUF336  39.71 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05610  hypothetical protein  39.86 
 
 
155 aa  103  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.237845  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1852  hypothetical protein  38.89 
 
 
182 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202299  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0133  protein of unknown function DUF336  46.85 
 
 
159 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1367  hypothetical protein  40.26 
 
 
169 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1411  hypothetical protein  39.61 
 
 
169 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.851451  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0245  protein of unknown function DUF336  34.97 
 
 
155 aa  86.3  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12350  hypothetical protein  36.36 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4563  hypothetical protein  38.28 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172322  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66044  predicted protein  33.57 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.148486  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1419  hypothetical protein  37.5 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0937  hypothetical protein  37.5 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415514  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1397  hypothetical protein  36.72 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.851845 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1338  hypothetical protein  36.36 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1896  hypothetical protein  34.07 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1299  hypothetical protein  35.29 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02061  alcohol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04590)  35.88 
 
 
439 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2865  protein of unknown function DUF336  27.97 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0168022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>