16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29130 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_29130  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  341  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46889  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2456  hypothetical protein  52.2 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3481  hypothetical protein  51.1 
 
 		 180 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.605279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2465  hypothetical protein  50.28 
 
 		 180 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2290  hypothetical protein  50.55 
 
 		 180 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.803647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1984  fimbrial assembly  52.17 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207869  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3225  hypothetical protein  37.5 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2417  fimbrial assembly  34.97 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2616  fimbrial assembly  34.25 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.863286 
 
 
-
 
NC_003296  RS02974  hypothetical protein  33.72 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4709  hypothetical protein  33.52 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3881  hypothetical protein  44.74 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2586  transmembrane protein  32.39 
 
 		 174 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1297  transmembrane protein  41.11 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1339  hypothetical protein  31.41 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2306  hypothetical protein  32.04 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.256089  normal  0.206542 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>