18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_27880 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_27880  flagellar protein  100 
 
 
131 aa  251  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2012  hypothetical protein  38.94 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5620  flagellar protein FlhE precursor  33.9 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.78281  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3703  flagellar protein flhE precursor  31.36 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0317567 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2332  flagellar protein FlhE  36.44 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.296674  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2430  flagellar FlhE family protein  36.44 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1762  flagellar FlhE family protein  35.34 
 
 
130 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.694188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01838  hypothetical protein  35.34 
 
 
130 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2171  flagellar protein FlhE  35.34 
 
 
130 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2110  flagellar protein FlhE  35.34 
 
 
130 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1973  flagellar protein FlhE  35.34 
 
 
130 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01849  hypothetical protein  35.34 
 
 
122 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1754  flagellar FlhE family protein  34.48 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1309  flagellar protein FlhE  34.78 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.395952 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1864  flagellar FlhE family protein  26.32 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2445  flagellar FlhE family protein  34.78 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1521  flagellar FlhE family protein  30.85 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1549  flagellar FlhE family protein  27.12 
 
 
140 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>