18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_08820 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_08820  Phenol hydroxylase subunit P4  100 
 
 
119 aa  244  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3307  phenol hydroxylase region  63.87 
 
 
119 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1703  phenol hydroxylase region  53.33 
 
 
120 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1783  phenol hydroxylase region  53.33 
 
 
120 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30720  Multi-component phenol hydoxylase, gamma subunit; LapO  45.76 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51766  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3112  Phenol hydroxylase conserved region  47.86 
 
 
119 aa  114  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0210  phenol hydroxylase region  47.01 
 
 
118 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5684  phenol hydroxylase region  46.15 
 
 
122 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3551  Phenol hydroxylase conserved region  46.15 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2281  phenol hydrolase gammma subunit  43.33 
 
 
120 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4627  Phenol hydroxylase conserved region  46.15 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2792  phenol hydroxylase region  43.7 
 
 
118 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3305  phenol hydrolase gammma subunit  40.17 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3359  phenol hydroxylase region  42.86 
 
 
118 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3793  phenol hydroxylase region  41.59 
 
 
118 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000826781  hitchhiker  0.00225505 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2967  phenol hydroxylase region  41.88 
 
 
118 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1327  phenol hydroxylase region  40.34 
 
 
118 aa  92  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0527  phenol hydroxylase subunit P4  37.14 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>