18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01770 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_01770  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  668    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6275  hypothetical protein  60.77 
 
 		 340 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72300  hypothetical protein  59.94 
 
 		 346 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0120  hypothetical protein  59.09 
 
 		 395 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5084  hypothetical protein  61.21 
 
 		 340 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0424557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0143  hypothetical protein  60.67 
 
 		 341 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109428  normal  0.11094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0159  hypothetical protein  60.3 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0161  hypothetical protein  60.67 
 
 		 341 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2156  hypothetical protein  63.5 
 
 		 341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00627834  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0067  hypothetical protein  59.09 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0036  hypothetical protein  57.27 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326703  normal  0.177153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3543  hypothetical protein  57.5 
 
 		 365 aa  301  9e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.571666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2394  hypothetical protein  48.04 
 
 		 376 aa  290  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0714  hypothetical protein  30.64 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2318  hypothetical protein  34.58 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000668387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0953  hypothetical protein  29.91 
 
 		 114 aa  46.2  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2488  hypothetical protein  29.93 
 
 		 131 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2048  hypothetical protein  29.41 
 
 		 133 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000179688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>