14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9196 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011984  Avi_9196  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  542  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1309  phosphosulfolactate synthase  24.44 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0118  phosphosulfolactate synthase  21.89 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.813148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2359  Phosphosulfolactate synthase  22.78 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1677  phosphosulfolactate synthase  23.46 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21790  Phosphosulfolactate synthase  22.78 
 
 
280 aa  55.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2563  phosphosulfolactate synthase  25.38 
 
 
280 aa  53.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0251636  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0153  phosphosulfolactate synthase  20.7 
 
 
251 aa  52.4  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1713  (2R)-phospho-3-sulfolactate synthase ComA  25.1 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.178787  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1603  Phosphosulfolactate synthase  24.68 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.615901  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1285  phosphosulfolactate synthase  19.92 
 
 
251 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1301  Phosphosulfolactate synthase  24.15 
 
 
275 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1399  phosphosulfolactate synthase  20.35 
 
 
235 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.118885  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0441  phosphosulfolactate synthase  22.66 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>