16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9166 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011984  Avi_9166  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  314  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9554  hypothetical protein  64.33 
 
 
158 aa  203  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409532  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8094  hypothetical protein  60 
 
 
157 aa  197  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18901  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4751  hypothetical protein  62.5 
 
 
157 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4977  hypothetical protein  57.69 
 
 
158 aa  183  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4147  hypothetical protein  55.41 
 
 
158 aa  176  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3152  hypothetical protein  56.05 
 
 
158 aa  174  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139479  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4660  hypothetical protein  54.14 
 
 
158 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.928661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4318  hypothetical protein  56.69 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0273  hypothetical protein  53.5 
 
 
158 aa  166  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3820  hypothetical protein  52.87 
 
 
157 aa  164  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.487425  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4595  hypothetical protein  52.87 
 
 
158 aa  161  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0428706  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4478  hypothetical protein  52.87 
 
 
157 aa  154  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0255771  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4752  hypothetical protein  43.31 
 
 
157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.343573  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4959  hypothetical protein  48.51 
 
 
216 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.347488  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0379  hypothetical protein  38.22 
 
 
157 aa  97.4  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>