20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7582 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7582  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  188  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.870331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1413  hypothetical protein  62.22 
 
 		 94 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5398  hypothetical protein  67.57 
 
 		 93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0062  hypothetical protein  60 
 
 		 93 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.143041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2710  hypothetical protein  60 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2624  hypothetical protein  56.98 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4566  hypothetical protein  51.65 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.505974  normal  0.611837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0557  hypothetical protein  54.44 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1997  hypothetical protein  54.44 
 
 		 95 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3473  hypothetical protein  52.94 
 
 		 94 aa  97.4  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2099  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.352052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3077  hypothetical protein  59.46 
 
 		 89 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1240  hypothetical protein  47.25 
 
 		 101 aa  87  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2057  hypothetical protein  52.31 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4692  hypothetical protein  52.38 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1112  hypothetical protein  45.71 
 
 		 93 aa  72  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.358741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1223  hypothetical protein  51.72 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1764  hypothetical protein  35.62 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.556792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13171  hypothetical protein  44.26 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4747  hypothetical protein  40.91 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0684106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>