15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7565 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7565  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  526  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0970  hypothetical protein  47.19 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.431239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1716  hypothetical protein  41.7 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.21992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2489  hypothetical protein  37.14 
 
 		 259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.721538  normal  0.0767999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6246  hypothetical protein  35.65 
 
 		 512 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0447  hypothetical protein  30.58 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2077  hypothetical protein  31.27 
 
 		 528 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3780  hypothetical protein  31.4 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2934  hypothetical protein  32.13 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.334803  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0647  hypothetical protein  31.82 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0913041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0486  hypothetical protein  28.21 
 
 		 290 aa  62  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3535  hypothetical protein  28.69 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0309  hypothetical protein  26.97 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.858216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4932  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.21 
 
 		 520 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.908823  normal  0.398469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0407  hypothetical protein  29.96 
 
 		 277 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126059  normal  0.0696554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>