17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5538 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5538  cellulose synthesis protein  100 
 
 		 760 aa  1516    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1207  hypothetical protein  44.94 
 
 		 799 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.907173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1296  hypothetical protein  47 
 
 		 791 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5211  hypothetical protein  46.99 
 
 		 705 aa  552  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0104  hypothetical protein  33.17 
 
 		 982 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0272  hypothetical protein  33.26 
 
 		 669 aa  208  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.937532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4802  hypothetical protein  32.39 
 
 		 652 aa  204  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.653605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3738  hypothetical protein  33.33 
 
 		 664 aa  203  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1370  hypothetical protein  32.94 
 
 		 687 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.103555  normal  0.0562053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1570  hypothetical protein  32.7 
 
 		 654 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0379435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1315  hypothetical protein  31.26 
 
 		 678 aa  194  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4796  hypothetical protein  31.37 
 
 		 622 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308009  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4176  hypothetical protein  38.16 
 
 		 458 aa  91.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1975  hypothetical protein  35.89 
 
 		 469 aa  90.5  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.898955  normal  0.425307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0965  hypothetical protein  37.58 
 
 		 472 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0330  hypothetical protein  42.16 
 
 		 134 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.431782  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 543 aa  48.9  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>