205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3436 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3436  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  659    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2902  protein of unknown function DUF403  77.88 
 
 		 313 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0224401  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3167  protein of unknown function DUF403  77.24 
 
 		 313 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78656  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4481  hypothetical protein  73.72 
 
 		 313 aa  491  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3525  hypothetical protein  64.22 
 
 		 313 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3243  protein of unknown function DUF403  59.29 
 
 		 313 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.622623  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1780  hypothetical protein  56.41 
 
 		 313 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2053  hypothetical protein  56.09 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3414  hypothetical protein  57.37 
 
 		 313 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.217438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1935  hypothetical protein  56.73 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1921  hypothetical protein  56.41 
 
 		 313 aa  378  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4257  hypothetical protein  57.37 
 
 		 313 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4109  hypothetical protein  57.37 
 
 		 313 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00537725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0772  hypothetical protein  56.09 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.715045  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1065  hypothetical protein  56.09 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0766  hypothetical protein  56.09 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0675  hypothetical protein  56.09 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2040  hypothetical protein  56.09 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0798659  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3520  hypothetical protein  56.41 
 
 		 313 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4108  hypothetical protein  56.41 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4003  hypothetical protein  56.73 
 
 		 313 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0922511  normal  0.156692 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2677  hypothetical protein  53.7 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174455  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0007  hypothetical protein  53.04 
 
 		 314 aa  355  6.999999999999999e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.441698 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1814  hypothetical protein  52.09 
 
 		 313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0331912  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2774  hypothetical protein  49.84 
 
 		 315 aa  330  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2115  hypothetical protein  51.6 
 
 		 313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.107173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2165  protein of unknown function DUF403  45.83 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7511  protein of unknown function DUF403  45.83 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0621482  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0583  hypothetical protein  46.15 
 
 		 315 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6764  hypothetical protein  46.15 
 
 		 314 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.360526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1566  hypothetical protein  43.23 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281936  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3539  hypothetical protein  45.54 
 
 		 316 aa  260  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1079  hypothetical protein  43.23 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2300  protein of unknown function DUF403  44.51 
 
 		 319 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0330793 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2416  hypothetical protein  42.9 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2209  hypothetical protein  45.51 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2485  protein of unknown function DUF403  45.51 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2470  protein of unknown function DUF403  45.05 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5274  hypothetical protein  44.55 
 
 		 314 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1941  hypothetical protein  44.37 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572678 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3051  hypothetical protein  44.03 
 
 		 319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2239  hypothetical protein  44.73 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.580599  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3217  hypothetical protein  44.73 
 
 		 314 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0392  hypothetical protein  43.09 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3875  protein of unknown function DUF403  42.44 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3158  hypothetical protein  43.59 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0824  hypothetical protein  41.51 
 
 		 319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1311  protein of unknown function DUF403  42.86 
 
 		 333 aa  238  6.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.754495  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2473  hypothetical protein  41.14 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.353765  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0405  hypothetical protein  39.37 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1428  hypothetical protein  37.07 
 
 		 325 aa  226  6e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3402  protein of unknown function DUF403  38.41 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.454494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2549  hypothetical protein  40.69 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459959  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1207  hypothetical protein  39.5 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2606  hypothetical protein  39.37 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1122  hypothetical protein  37.94 
 
 		 316 aa  219  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.225451  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1354  hypothetical protein  38.51 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.531652  hitchhiker  0.00962099 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3020  hypothetical protein  40.38 
 
 		 315 aa  216  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00142607  normal  0.658817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0965  protein of unknown function DUF403  37.62 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1061  protein of unknown function DUF403  37.94 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.823298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0936  protein of unknown function DUF403  37.93 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1021  hypothetical protein  37.93 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434907  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1084  hypothetical protein  38.02 
 
 		 317 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5078  hypothetical protein  37.19 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605764 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3389  hypothetical protein  37.34 
 
 		 345 aa  209  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0520  hypothetical protein  38.66 
 
 		 311 aa  209  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582097  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3156  hypothetical protein  37.03 
 
 		 320 aa  208  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0396  protein of unknown function DUF403  35.29 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.995526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3593  protein of unknown function DUF403  37.13 
 
 		 324 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4767  protein of unknown function DUF403  37.62 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4512  hypothetical protein  37.46 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2596  hypothetical protein  36.94 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0574332  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4444  protein of unknown function DUF403  38.1 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4494  protein of unknown function DUF403  36.33 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4430  protein of unknown function DUF403  36.33 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0764  hypothetical protein  37.78 
 
 		 316 aa  202  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2687  hypothetical protein  35.35 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0355776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4414  protein of unknown function DUF403  34.82 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3066  hypothetical protein  35.35 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1048  hypothetical protein  35.9 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0181882  normal  0.326786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2060  hypothetical protein  37.54 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1736  hypothetical protein  36.31 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3107  hypothetical protein  34.71 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0070  hypothetical protein  36.33 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0505568  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1492  protein of unknown function DUF403  34.41 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0309521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3012  hypothetical protein  34.39 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1870  hypothetical protein  37.22 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.088676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1050  hypothetical protein  34.08 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1033  hypothetical protein  35.05 
 
 		 318 aa  192  6e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.403724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37680  hypothetical protein  34.08 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.454306  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11431  hypothetical protein  33.44 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11441  hypothetical protein  33.44 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2637  hypothetical protein  33.87 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37252  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3575  hypothetical protein  35.44 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2265  hypothetical protein  31.95 
 
 		 327 aa  185  9e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42150  hypothetical protein  35.44 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0732  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.109994  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15701  hypothetical protein  33.23 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.743902  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0539  hypothetical protein  33.87 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0363  hypothetical protein  32.8 
 
 		 309 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>