19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3001 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3001  major head subunit protein  100 
 
 		 298 aa  616  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1304  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  55.52 
 
 		 298 aa  345  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2096  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  55.52 
 
 		 298 aa  345  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3356  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  53.54 
 
 		 296 aa  332  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1607  Mu-like prophage major head subunit gpT  51.01 
 
 		 298 aa  324  9e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584098  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4497  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  52.84 
 
 		 298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1637  hypothetical protein  47.7 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0735  hypothetical protein  48.7 
 
 		 309 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0095  hypothetical protein  42.95 
 
 		 299 aa  279  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131989  normal  0.289582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2098  prophage MuSo1, major head subunit, putative  46.71 
 
 		 306 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.168211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2144  prophage MuSo1, major head subunit, putative  48.28 
 
 		 306 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0675  prophage MuSo1, major head subunit, putative  45.72 
 
 		 306 aa  269  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1882  Mu-like prophage major head subunit  47.83 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0755  major head subunit  42.05 
 
 		 299 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0682  major head subunit  42.05 
 
 		 299 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2243  Mu-like prophage major head subunit gpT  45 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2685  prophage MuSo2, major head subunit, putative  38.87 
 
 		 299 aa  229  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1962  major head subunit protein  51.41 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.248362 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0952  Mu-like protein prophage major head subunit gpT-like protein  26.26 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000512523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>