14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0720 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0720  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  305  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.616266  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0340  hypothetical protein  68.79 
 
 		 147 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0308  hypothetical protein  69.12 
 
 		 147 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0245  hypothetical protein  60.28 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.550911  normal  0.350081 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4223  hypothetical protein  49.63 
 
 		 142 aa  144  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0111  hypothetical protein  47.41 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287023  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0120  hypothetical protein  48.09 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0308  hypothetical protein  45.59 
 
 		 144 aa  131  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1154  hypothetical protein  39.16 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0647  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0636  hypothetical protein  39.2 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0349897  normal  0.38288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0615  hypothetical protein  38.4 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.502178 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0023  hypothetical protein  38.89 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3218  hypothetical protein  34.62 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>