12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0158 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0158    100 
 
 
525 bp  1041    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0261  transposase IS4  87.23 
 
 
1023 bp  494  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3153  transposase IS4  87.23 
 
 
1023 bp  494  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0912286  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0160  putative transposase  96.15 
 
 
231 bp  389  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4497  transposase IS4 family protein  90.32 
 
 
1020 bp  75.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4477    92.31 
 
 
1061 bp  71.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3382  transposase IS4 family protein  92.31 
 
 
1020 bp  71.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3846  transposase IS4 family protein  92.31 
 
 
1020 bp  71.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2795    92.31 
 
 
701 bp  71.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3144    92.31 
 
 
719 bp  71.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00923017  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3633  transposase IS4 family protein  86.54 
 
 
1020 bp  48.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  96.3 
 
 
1140 bp  46.1  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>