17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0149 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0149  metallothionein, family protein  100 
 
 
76 aa  156  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2545  metallothionein family 14  68.52 
 
 
55 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0887  metallothionein family 14  66.04 
 
 
57 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.797466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0861  metallothionein family 14  66.04 
 
 
57 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2843  metallothionein family protein  53.7 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2961  metallothionein family 14  53.7 
 
 
57 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3069  metallothionein family 14  53.7 
 
 
57 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175676  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2070  metallothionein family protein  52.63 
 
 
58 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106237  hitchhiker  0.00805122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0440  metallothionein family 14  50.88 
 
 
58 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.711747  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5147  metallothionein family protein  46.3 
 
 
57 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1290  SmtA metallothionein  50 
 
 
56 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.488422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2674  metallothionein family 14  58.54 
 
 
43 aa  51.2  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3014  metallothionein  44 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.797789 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2885  metallothionein, family protein  40.68 
 
 
58 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.98624  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3171  putative metallothionein  46.67 
 
 
79 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36890  putative metallothionein  46.67 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0397496  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2649  metallothionein  40 
 
 
76 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>