14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2638 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2638  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  297  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4063  hypothetical protein  38.24 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498867 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0787  hypothetical protein  29.37 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14711  hypothetical protein  33.63 
 
 
178 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0323724 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2066  hypothetical protein  30.77 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.126661  normal  0.369814 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1331  hypothetical protein  29.52 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0828445 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3970  hypothetical protein  26.42 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2205  hypothetical protein  26.09 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323725  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2503  hypothetical protein  31.37 
 
 
350 aa  43.5  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231485  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0789  hypothetical protein  26.42 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1143  hypothetical protein  31.11 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0740  hypothetical protein  26.42 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0429  hypothetical protein  24.56 
 
 
136 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0510307  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0016  hypothetical protein  28 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>