152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_R0052 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_R0052  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0013  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0073  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0583233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0023  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.805524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0002  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00190124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0573  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2944  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2947  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2950  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0349491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0559  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2627  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2630  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.842478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2633  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.449079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0082  tRNA-Glu  95.56 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0019  tRNA-Glu  95.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0031  tRNA-Glu  94.87 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0063  tRNA-Glu  94.87 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0050  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.162753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0062  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161369  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0001  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0030  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000352546  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0077  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0063  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276545  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0001  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0030  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0077  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4775  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000223531  hitchhiker  0.00000000000000424318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5646  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000268036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5649  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5658  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5673  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000836354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5706  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5711  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.434676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0092  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0169  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0185201 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5248  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000518597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5146  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000335132  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5798  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5708  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0680587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00381544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0124821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000814932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00786644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000632296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0012905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000917456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000147192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.350653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5665  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000601251  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0014  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000021205  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-5  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000919023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-6  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00323407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0034  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0069  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0526  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33331e-28 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0044  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000289195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0271  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5343  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183126  hitchhiker  0.00000000000862648 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5051  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4560  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 153 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000215336  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5653  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000310827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0871  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 153 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0602  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5652  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000748883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0293  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000258541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0796  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 153 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.41258e-33 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5575  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.70531e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0014  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000839955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0035  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0044  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000245211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0076  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0112  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0106967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0118  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.309686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0147  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000517529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0190  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000533026  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0014  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0791017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0035  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0044  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0079  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0116  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00563639  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0122  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0151  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000210391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0233  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00200909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5832  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>