54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0920 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0920  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 		 255 aa  503  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000818747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0789  RNA-binding S4  34.38 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3911  S4 domain protein  29.49 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000445845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3942  S4 domain-containing protein  28.57 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1907  RNA-binding S4 domain protein  29.49 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3949  S4 domain protein  29.03 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000108737  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1037  RNA-binding S4 domain protein  31.48 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000298489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3656  S4 domain-containing protein  29.03 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2546  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.73 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0803565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3639  S4 domain-containing protein  29.03 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000680133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1318  RNA-binding S4 domain protein  31.44 
 
 		 265 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.210837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4036  s4 domain-containing protein  28.57 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00128697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3748  S4 domain-containing protein  28.57 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.125171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3724  RNA-binding S4 domain-containing protein  28.11 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195579  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3998  S4 domain protein  27.65 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000894164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1243  S4 domain protein  27.19 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000893019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1275  RNA-binding S4 domain-containing protein  27.23 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000253973  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1250  RNA-binding S4 domain-containing protein  27.23 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000129333  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0756  ylmH protein  27.4 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.031626  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09250  RNA-binding S4 domain protein  29.57 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0028436  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0596  RNA-binding S4 domain-containing protein  28.44 
 
 		 261 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000430784  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1086  RNA-binding S4 domain protein  31.14 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000637661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1889  RNA-binding S4 domain-containing protein  29.63 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000373186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0715  RNA-binding S4 domain-containing protein  28.06 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.369549  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0599  RNA-binding S4 domain protein  28.5 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000013354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1012  RNA-binding S4  27.45 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2321  photosystem II S4 domain protein  27.48 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4198  RNA-binding S4  28.06 
 
 		 259 aa  88.6  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0781  cell division protein  30.56 
 
 		 266 aa  86.3  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0824201  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5081  photosystem II S4 domain-containing protein  28.97 
 
 		 259 aa  85.5  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.673535  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1503  RNA-binding S4  24.8 
 
 		 259 aa  85.1  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4774  photosystem II S4 domain protein  26.43 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1264  RNA-binding S4 domain protein  34.25 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0483  ylmH protein  25.22 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2846  photosystem II S4 domain protein  25.29 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3250  photosystem II S4 domain protein  25.29 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2106  S4 domain-containing protein  35.48 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00816123  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1820  S4 domain-containing protein  30.3 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000243371  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1347  RNA-binding S4 domain protein  28.51 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000348222  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1489  cell division protein  32.26 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2058  cell division protein  25.22 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2360  RNA-binding S4 domain-containing protein  30 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000894269  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1087  RNA-binding S4 domain protein  31.03 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1140  cell division protein  27.03 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1198  cell division protein  25.54 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4044  RNA-binding S4 domain protein  32.24 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223229  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1296  hypothetical protein  26.76 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41009  predicted protein  25.88 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.106009  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0953  RNA-binding S4 domain protein  31.08 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  35.44 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0877  RNA-binding S4 domain protein  21.1 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0318  ribosomal protein S4  35.19 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.665336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  29.87 
 
 		 206 aa  42  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  32.73 
 
 		 206 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>