27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_R0058 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_R0058  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0207136  hitchhiker  0.00175825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0013  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428815  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0015  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0051  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.321747  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0047  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0066  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14036  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000697589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0037  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.461495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0012  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0016  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0012  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0024  tRNA-Gln  86.57 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09030  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0059  tRNA-Gln  85.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0228294  hitchhiker  0.00351728 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0013  tRNA-Gln  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0041  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000696806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0061  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0068  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0014  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677743  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0022  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0036  tRNA-Gln  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.868665  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0023  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.692118 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0042  tRNA-Gln  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0053  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0021  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585103  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0022  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.113221  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0006  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>