19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2168 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_2168  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 537 aa  1091    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1851  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 		 571 aa  63.9  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2335  Tetratricopeptide domain protein  25.42 
 
 		 563 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014328 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0768  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 552 aa  57.4  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.36 
 
 		 572 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2675  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.36 
 
 		 572 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0555  tetratricopeptide region  25.54 
 
 		 560 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.45789  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2694  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 580 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.407623  normal  0.0520639 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20870  Tetratricopeptide repeat (TPR) protein  23.41 
 
 		 539 aa  54.3  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1371  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 601 aa  50.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5657  tetratricopeptide TPR_4  25.23 
 
 		 530 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3942  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 563 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  0.567153 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1969  hypothetical protein  27.65 
 
 		 581 aa  49.7  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1942  tetratricopeptide TPR_4  23.71 
 
 		 530 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1877  hypothetical protein  26.59 
 
 		 587 aa  49.7  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.220347  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0989  hypothetical protein  22.79 
 
 		 577 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.659659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1581  Tetratricopeptide domain protein  26.07 
 
 		 578 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00337533  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0725  tetratricopeptide repeat protein  30.14 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0176529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4467  Tetratricopeptide repeat protein  25.56 
 
 		 568 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>