10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5109 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5109  hypothetical protein  100 
 
 		 583 aa  1112    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6957  hypothetical protein  31.63 
 
 		 652 aa  182  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5727  hypothetical protein  30.78 
 
 		 614 aa  177  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.58442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6917  hypothetical protein  36.64 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1515  hypothetical protein  30.86 
 
 		 795 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2654  radical SAM domain-containing protein  34.44 
 
 		 781 aa  101  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0138301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1604  hypothetical protein  31.34 
 
 		 445 aa  100  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0512  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 		 815 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.663169  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7955  Radical SAM domain protein  33.07 
 
 		 794 aa  91.3  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.025578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2364  hypothetical protein  31.55 
 
 		 331 aa  43.5  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0996966  hitchhiker  0.00832001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>