11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4656 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4656  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  510  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0689  hypothetical protein  48.09 
 
 		 252 aa  234  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1260  hypothetical protein  38.4 
 
 		 266 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.503524  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1714  hypothetical protein  35.25 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0908  hypothetical protein  36.97 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.86539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1804  2OG-Fe(II) oxygenase  27.73 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.130768 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2315  hypothetical protein  29 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1346  hypothetical protein  27.18 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0182912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2209  hypothetical protein  26.56 
 
 		 280 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131678  normal  0.543149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2382  hypothetical protein  27.66 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.956505  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0945  hypothetical protein  22.61 
 
 		 259 aa  42  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>