19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4221 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4221  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  352  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5504  hypothetical protein  32.23 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00506408  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23530  hypothetical protein  35.51 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0377925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14040  hypothetical protein  35.09 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.593323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6386  hypothetical protein  37.25 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.320315  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2684  hypothetical protein  33.93 
 
 		 131 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6455  hypothetical protein  43.18 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5552  hypothetical protein  35 
 
 		 120 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2867  hypothetical protein  32.65 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.600163  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32830  hypothetical protein  33.94 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5164  hypothetical protein  32.38 
 
 		 276 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8485  hypothetical protein  39.51 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8102  hypothetical protein  36.59 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07840  hypothetical protein  36.27 
 
 		 130 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2641  hypothetical protein  31.03 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.959091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9190  hypothetical protein  29.41 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9099  hypothetical protein  29.59 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2153  hypothetical protein  28.97 
 
 		 152 aa  41.2  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>