16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3221 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3221  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1573  VTC domain protein  56.63 
 
 		 294 aa  232  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.375137  hitchhiker  0.00558819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3117  hypothetical protein  51.34 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0313259  normal  0.140705 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3226  hypothetical protein  52.59 
 
 		 260 aa  201  9e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3209  hypothetical protein  52.73 
 
 		 268 aa  178  8e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.435311  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13050  VTC domain-containing protein  48.78 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1904  hypothetical protein  44.94 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4795  VTC domain protein  43.15 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03050  VTC domain-containing protein  45.31 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0852  hypothetical protein  43.2 
 
 		 277 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.538253  normal  0.0167402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1332  hypothetical protein  42.8 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 		 735 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1490  hypothetical protein  33.46 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00472854  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2816  hypothetical protein  30.12 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.850496  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2551  hypothetical protein  35.27 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3873  hypothetical protein  30.84 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.212389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>