24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1539 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1539  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 94 aa  183  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0355  hypothetical protein  46.94 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.659546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1457  hypothetical protein  43.66 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.681293 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2996  prevent-host-death family protein  53.66 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206214  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2735  prevent-host-death family protein  53.66 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1766  prevent-host-death family protein  38.3 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0956656  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4395  hypothetical protein  38.95 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10637  hypothetical protein  45.45 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000182741  normal  0.496529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0212  prevent-host-death family protein  47.62 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.655671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5934  prevent-host-death family protein  46.34 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0339897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5532  prevent-host-death protein  46.34 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.791012  normal  0.352518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13419  hypothetical protein  39.08 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000985645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10608  hypothetical protein  53.85 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.506196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0142  prevent-host-death protein  54.05 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5571  prevent-host-death family protein  43.59 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00661607  normal  0.119215 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2596  prevent-host-death family protein  40.74 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2966  prevent-host-death family protein  57.89 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00596285  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2983  prevent-host-death family protein  40.74 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.413921  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2901  prevent-host-death family protein  54.05 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3325  prevent-host-death family protein  48.65 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3713  prevent-host-death family protein  40.28 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2221  prevent-host-death family protein  34.07 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3784  hypothetical protein  45.24 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640007  decreased coverage  0.000191951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4434  prevent-host-death protein  38.33 
 
 		 79 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0804206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>