9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0887 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0887  hypothetical protein  100 
 
 		 647 aa  1298    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07290  hypothetical protein  49.16 
 
 		 642 aa  555  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4736  hypothetical protein  26.4 
 
 		 643 aa  118  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4300  hypothetical protein  27.56 
 
 		 644 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.908642  normal  0.295604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0485  hypothetical protein  25.1 
 
 		 623 aa  99.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0404409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3056  hypothetical protein  22.65 
 
 		 657 aa  84.3  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.98238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1101  hypothetical protein  25.73 
 
 		 782 aa  84  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0146  hypothetical protein  24.34 
 
 		 782 aa  70.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8471  hypothetical protein  23.94 
 
 		 812 aa  63.9  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>