18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0535 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0535  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  293  6e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000537428  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.593323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3481  hypothetical protein  35.92 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6455  hypothetical protein  28.18 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8082  hypothetical protein  31.19 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21050  hypothetical protein  32.53 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0401798  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32830  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2153  hypothetical protein  36.27 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5661  hypothetical protein  26.92 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6386  hypothetical protein  37.5 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.320315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4298  hypothetical protein  35.16 
 
 		 248 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2867  hypothetical protein  34.04 
 
 		 231 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.600163  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6444  Chromosome segregation ATPase-like protein  34.72 
 
 		 880 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.841582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4870  hypothetical protein  38.71 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1261  hypothetical protein  37.35 
 
 		 103 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9190  hypothetical protein  28.42 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5552  hypothetical protein  32.48 
 
 		 120 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0156  hypothetical protein  36.25 
 
 		 139 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>