31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0470 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0470  thiamineS protein  100 
 
 		 87 aa  165  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34170  molybdopterin converting factor, small subunit  63.41 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4962  thiamineS protein  52.38 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.806952  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4478  thiamineS  52.33 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4565  thiamineS protein  52.33 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4861  thiamineS protein  52.33 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0539176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5048  thiamineS protein  51.16 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4752  thiamineS protein  48.91 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10885  molybdenum cofactor biosynthesis protein D 2 moaD2  52.33 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91513e-26  normal  0.142298 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1754  thiamineS protein  49.43 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.593582  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1704  thiamineS protein  50 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1443  thiamineS protein  51.65 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0822  thiamineS protein  47.62 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5047  thiamineS protein  50 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0445  thiamine S  42.22 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2024  thiamineS protein  47.73 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.930246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4537  thiamineS protein  47.06 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1439  thiamineS protein  47.73 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0227652  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0356  thiamineS protein  46.55 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20020  hypothetical protein  39.29 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3626  thiamineS protein  47.76 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.014511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1691  thiamineS protein  38.1 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0596  thiamineS protein  43.33 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2736  putative molybdopterin converting factor  43.18 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1232  thiamine S protein  48.84 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08550  ThiS family protein  41.82 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.266586  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19310  molybdopterin converting factor, small subunit  45.61 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344734  normal  0.0247998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4239  thiamineS protein  37.36 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1248  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1180  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.37 
 
 		 217 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1833  thiamineS protein  44.07 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.308213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>