12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3166 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3166  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  288  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2513  hypothetical protein  98.65 
 
 		 148 aa  284  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0620  hypothetical protein  55.56 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03856  hypothetical protein  52.08 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.857117  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0764  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.503732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61000  hypothetical protein  55.07 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5250  hypothetical protein  56.12 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4061  hypothetical protein  39.04 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1023  hypothetical protein  42.75 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2694  hypothetical protein  42.95 
 
 		 166 aa  98.6  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13541  hypothetical protein  38.62 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1989  hypothetical protein  35.59 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.198765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>