15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2528 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_15600  hypothetical protein  92.09 
 
 
394 aa  734    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000896111  unclonable  6.48725e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2528  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  812    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.122585  hitchhiker  0.000213496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5331  putative cytoplasmic protein  65.64 
 
 
389 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4501  hypothetical protein  61.08 
 
 
409 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0854244  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1284  YeeC-like protein  59.19 
 
 
397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1752  YeeC-like protein  59.7 
 
 
391 aa  450  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.870079  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3048  YeeC-like protein  61.32 
 
 
392 aa  438  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0265  hypothetical protein  54.87 
 
 
391 aa  401  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.77928  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3313  conserved hypothetical cytosolic protein  53.32 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1964  Putative helicase A859L  50.51 
 
 
403 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112018  normal  0.0337679 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1467  hypothetical protein  33.33 
 
 
444 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3041  hypothetical protein  33.41 
 
 
419 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0030  hypothetical protein  34.72 
 
 
446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0761  hypothetical protein  31.65 
 
 
398 aa  176  7e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0739979  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15100  T5orf172 domain-containing protein  43.75 
 
 
71 aa  60.1  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.177671  normal  0.7549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>