16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2178 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2178  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  241  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.207131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2402  hypothetical protein  97.54 
 
 		 122 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3432  hypothetical protein  56.56 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275835  normal  0.581055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4187  hypothetical protein  50.82 
 
 		 119 aa  117  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1390  hypothetical protein  52.46 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1176  hypothetical protein  43.36 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1248  hypothetical protein  47.54 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1617  hypothetical protein  46.81 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0427  hypothetical protein  44.26 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0940  hypothetical protein  46.99 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2361  hypothetical protein  53.15 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000168319  unclonable  0.000000122129 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0691  hypothetical protein  54.39 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0581  hypothetical protein  45.36 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2867  hypothetical protein  54.46 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.438274  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0739  hypothetical protein  49.43 
 
 		 221 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355396  normal  0.7194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0840  hypothetical protein  28.26 
 
 		 138 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>