15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1248 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1248  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  249  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1176  hypothetical protein  80 
 
 
125 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3432  hypothetical protein  68.6 
 
 
119 aa  163  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275835  normal  0.581055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4187  hypothetical protein  61.98 
 
 
119 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1390  hypothetical protein  67.5 
 
 
120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2361  hypothetical protein  59.02 
 
 
119 aa  106  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000168319  unclonable  0.000000122129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2402  hypothetical protein  48.36 
 
 
122 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1617  hypothetical protein  44.17 
 
 
127 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0427  hypothetical protein  51.24 
 
 
121 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2178  hypothetical protein  47.54 
 
 
122 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.207131  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0940  hypothetical protein  41.32 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2867  hypothetical protein  47.54 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.438274  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0691  hypothetical protein  45.45 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0739  hypothetical protein  40 
 
 
221 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355396  normal  0.7194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0581  hypothetical protein  35.87 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>