18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0210 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0210  phenol hydroxylase region  100 
 
 
118 aa  244  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3359  phenol hydroxylase region  81.36 
 
 
118 aa  208  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2792  phenol hydroxylase region  78.81 
 
 
118 aa  198  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3551  Phenol hydroxylase conserved region  78.51 
 
 
121 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4627  Phenol hydroxylase conserved region  78.51 
 
 
121 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1327  phenol hydroxylase region  74.14 
 
 
118 aa  186  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5684  phenol hydroxylase region  70.49 
 
 
122 aa  180  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2967  phenol hydroxylase region  66.38 
 
 
118 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3112  Phenol hydroxylase conserved region  63.03 
 
 
119 aa  155  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2281  phenol hydrolase gammma subunit  58.33 
 
 
120 aa  142  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3305  phenol hydrolase gammma subunit  52.99 
 
 
120 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1783  phenol hydroxylase region  52.54 
 
 
120 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1703  phenol hydroxylase region  48.31 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3793  phenol hydroxylase region  44.25 
 
 
118 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000826781  hitchhiker  0.00225505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3307  phenol hydroxylase region  45.38 
 
 
119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30720  Multi-component phenol hydoxylase, gamma subunit; LapO  48.25 
 
 
118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08820  Phenol hydroxylase subunit P4  47.01 
 
 
119 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0527  phenol hydroxylase subunit P4  26.61 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>