15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0203 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0203  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  537  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0772  hypothetical protein  35.34 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0620  hypothetical protein  35.34 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.228252  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1755  hypothetical protein  33.48 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.071754  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0829  hypothetical protein  27.95 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2064  hypothetical protein  28.14 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000220233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2020  hypothetical protein  23.49 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123308  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4220  hypothetical protein  24.41 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0467  hypothetical protein  24.91 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2158  hypothetical protein  28.14 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3413  hypothetical protein  24.55 
 
 		 285 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120615  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1227  hypothetical protein  23.95 
 
 		 249 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0996282  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1196  hypothetical protein  23.72 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2939  hypothetical protein  23.98 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1691  hypothetical protein  25.61 
 
 		 281 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>